التزمت حكومة الجنوب بعدم التدخل في الاجراءات الادارية وعمل هيئة الجمارك الا عبر الجمارك الاتحادية وكشف اللواء سيف الدين عمر سليمان مدير هيئة الجمارك ل (الرأى العام) عن التزام حكومة الجنوب تجاه عمل الجمارك بالجنوب عبر الاتحادية مؤكداً ان اهم ما خرجت به زيارة وزير المالية ومدير هيئة الجمارك لجنوب السودان توقيع اتفاق بين الطرفين لتوحيد حساب توريد كل الايرادات الجمركية ببنك جنوب السودان عبر حساب واحد تورد فيه كل متحصلات الجمارك ، كما تم الاتفاق على تطبيق المعايير الإتحادية خاصة فيما يتعلق بالفئات الجمركية الإتحادية في التعريفة الجمركية حتى تتناسق مع التعريفة الجمركية المطبقة حالياً في الجنوب ولتتلاشي الفئات المختلفة، وقال سيف الدين اذا كانت هنالك اية معالجات لبعض السلع التي تؤثر على المواطن سيتم النظر فيها عبر لجنة محددة، وأكد ان الاتفاق نص على ان تتم الاعفاءات التي تصدر من وزارة المالية بحكومة الجنوب وفق الاسس والانظمة المنظمة للإعفاءات الجمركية الصادرة من الحكومة الإتحادية، مؤكداً ان قرارات اللجنة المشتركة ستعالج كل القضايا العالقة بين حكومة الجنوب والاتحادية. كما تطرقت لكافة نقاط الخلاف خاصة فتح النقاط الجمركية وإعادة تأهيل النقاط الجمركية الحدودية التي من المتوقع بعد ان يتم تطبيقها مباشرة ان يصبح اداء الجمارك بنسبة عالية جداً وسترفع عمليات التنمية بالجنوب. وتوقع سيف الدين ان يسهم تنفيذ هذا الاتفاق في دفع عجلة التنمية بالجنوب واستقرار الاوضاع وتوحيد الفئات الجمركية بالجنوب لتتلاشى الازدواجية في الفئات المالية.