انتقدت قيادات بجبال النوبة استمرار الحركة الشعبية الدعوة لبرنامج السودان الجديد بجنوب كردفان بعد الانفصال. ووصف الأستاذ عبد العال جمعة أقرين القيادي السابق بالحركة الشعبية بجبال النوبة اتجاه بعض قيادات الحركة الشعبية بجبال النوبة لتبني استمرار الدعوة لإنفاذ برنامج السودان الجديد بالمحاولة الفاشلة لإنتاج نسخة أخرى من الحركة الشعبية في شمال السودان لتؤكد أنها مازالت سادرة في غيها وتنسى أو تتناسى أن ما يسمى بالسودان الجديد كان في الأصل شعار تكتيكي وتمويهي من الحركة الشعبية (الجنوبية النشأة والقيادة) والتي قامت بتعبئة أبناء جبال النوبة وغيرهم ضد الدولة المركزية السودانية وإنهاكهم بالحرب حتى يتسنى لها بعد ذلك تحقيق هدفها الإستراتيجي المتمثل في الانفصال عن الشمال وتأسيس دولتها المستقلة.وفي ذات السياق دعا أقرين قيادات الحركة الشعبية بجبال النوبة للإسراع بفك ارتباطهم السياسي والعسكري مع الحركة الشعبية قبل قيام الدولة الجنوبية والاتجاه نحو الحوار والتفاهم البناء مع المؤتمر الوطني بناءً على روح الشراكة الذكية السائدة بين شريكي الحكم في الولاية بقيادة الوالي أحمد هارون والفريق عبد العزيز الحلو وإلا فإن المنطقة برمتها ستكون نهباً لنمط جديد من الصراعات والأجندات المحلية والإقليمية والدولية.