رفض حزب الأمة القومي مطالبة قطاع الشمال بإقامة حكم ذاتي لمنطقتي النيل الأزرق وجنوب كردفان، مُحذّراً من أن تلك الدعوة تعمل على تكرار سيناريو حق تقرير المصير في جنوب السودان، وأكّد الحزب وقوفه مع الحكم القومي في إطار السودان الموحد. وأبدى رئيس المكتب السياسي للحزب بالإنابة محمد المهدي حسن اعتراض حزبه على طرح قطاع الشمال بالحكم الذاتي بالنيل الأزرق وجنوب كردفان، مبدياً خشيته من أنه يؤدي ذلك إلى تكرار سيناريو جنوب السودان، مُشيراً إلى أن كل القرارات حول المنطقتين لم يذكر فيها بند يشير إلى إقامة حكم ذاتي، وأضاف أن هذا أمر غير مجدٍ ويهدف لزيادة سقف مطالب الحركة. وأوضح حسن أن التدخلات الأجنبية وعلى رأسها دول الترويكا ساهمت بشكل كبير في تحويل مسار التفاوض، بممارسة الضغوط كي لا يتم التوصل الى اتفاق نهائي، يساعد في إعادة الاستقرار إلى المنطقتين، داعياً لمناقشة قضية المنطقتين والاعتراف بخصوصيتها من الطرفين. وأكد المهدي أن طرح قطاع الشمال يعمل على هزيمة وسائل الحل السلمي بالمنطقتين، لافتاً إلى أن ما يجري الآن لا يقدم حلولاً للمشكلة السودانية.