كشف تقرير المراجع العام عن تجاوزات ومخالفات خطيرة بالمستشفيات الاتحادية والولائية وأقر التقرير بوجود مشاكل في الصرف الصحي والنفايات الطبية بالمستشفيات. وقالت مصادر برلمانية فضلت حجب هويتها إن الشكاوى التي وردت في تقرير المراجع العام والمتعلقة بمستشفيات نهر النيل والجزيرة والبحر الاحمر والمستشفى التركي تمت مناقشتها وتابع التقرير يتطلب الزيارة الميدانية حتى يتسنى للجهات ذات الصلة إصدار قرار يلزم الجهاز التنفيذي وتابعت المصادر وجود اتجاه لاستدعاء وزير الصحة لذات الشكاوى وأشار التقرير لأن الصرف الصحي بمستشفى عطبرة غير مكتمل وحمل إدارة المستشفى بوجود ما أسماه التقرير عن وجود فراغات في الصرف الصحي أثرت على النظافة ودخلت إلى غرفة العملية الصغيرة وزاد ان محاليل غسيل الكلى موجودة في بيئة غير صالحة ومعرضة للرطوبة والحرارة في نفس الوقت لوجود ثقوب في المخزن وفي مستشفى بورت سودان كشف التقرير عن وجود تجاوزات في الاعتماد المالي لعام 2009 حتى العام 2011م يساوي (211,200) جنيه مبلغ مئتين وأحد عشر ألفاً ومئتي جنيه، وفي ذات الوقت الصرف الفعلي (447,750) أربعمائة وسبعة وأربعون ألفاً بتجاوز يفوق 111% عن الصرف الحقيقي. وزاد ان الصرف الحي متهالك بالمستشفى والنفيات الطبية تجمع في سلة صغيرة داخل المستشفى وابان التقريران الاستشارات الهندسية أوصت بعدم الجدوى من إعادة تأهيله.
