انتقدت قيادات بجبال النوبة استمرار الحركة الشعبية في الدعوة إلى برنامج السودان الجديد بجنوب كردفان بعد الانفصال. ووصف القيادي السابق بالحركة الشعبية بجبال النوبة؛ عبد العال جمعة أقرين، اتجاه بعض قيادات الحركة الشعبية بجبال النوبة لتبني استمرار الدعوة لإنفاذ برنامج السودان الجديد؛ بالمحاولة الفاشلة لإنتاج نسخة أخرى من الحركة الشعبية في شمال السودان لتؤكد بأنها مازالت سادرة في غيها وتنسى أو تتناسى أن ما يسمّى بالسودان الجديد كان في الأصل شعاراً تكتيكياً وتمويهياً من الحركة الشعبية (جنوبية النشأة والقيادة) التي قامت بتعبئة أبناء جبال النوبة وغيرهم ضد الدولة المركزية السودانية وإنهاكهم بالحرب حتى يتسنى لها بعد ذلك تحقيق هدفها الإستراتيجي المتمثل في الانفصال عن الشمال وتأسيس دولتها المستقلة.