أعلنت المفوضية القومية للاستفتاء النتائج النهائية للعملية يوم الإثنين في الخرطوم، وأظهرت النتائج أن سكان الإقليم اختاروا الانفصال بأغلبية كاسحة بلغت نسبته ما مجموعه 98.83 في المئة، ممهدة الطريق لقيام أحدث دولة في أفريقيا. وقال رئيس المفوضية البروفسور محمد إبراهيم خليل في مؤتمر صحفي بقاعة الصداقة في الخرطوم، إن عدد المسجلين للاستفتاء وصل إلى ثلاثة ملايين وتسعمائة وسبعة وأربعين ألفاً وستمائة ستة وسبعين. وأضاف: "بعد استثناء البطاقات التالفة تبين أن عدد الأصوات الصحيحة وصل إلى 3.837.406 منهم 44.888 صوتوا للوحدة بنسبة 1.17%، وصوت للانفصال 3.792.518 شخصاً، وبلغت جملة الناخبين 3.947.676، اقترع منهم 3.851.994 بنسبة 97.58%. وأوضح خليل أن نسبة التصويت لانفصال جنوب السودان حسب النتيجة الكلية 98.83%. الناخبون المسجلون وقال إن عدد الناخبين المسجلين بالولايات الجنوبية 3.770.600 ناخباً، صوت منهم 3.724.194 بنسبة 98.77% صوت منهم للوحدة عدد 16.129 ناخباً، بنسبة بلغت 0.43%، وللانفصال عدد 3.697.467 ناخباً، بنسبة بلغت 99.57%. وقال خليل إن عدد الناخبين المسجلين في الشمال بلغ 116.857 ناخباً مارسوا حقهم في الاقتراع، منهم 69.597 بنسبة 59.56% صوت منهم للوحدة 27.918 بنسبة 42.35% وصوت للانفصال 38.003 ناخبين، بنسبة 57.65%. وبلغ عدد المسجلين بدول المهجر حسب خليل 60.219 ناخباً، اقترع منهم 58.203 ناخبين بنسبة 96.65%، صوت منهم للوحدة 841 ناخباً، بنسبة 1.45% وللإنفصال 57.048 ناخباً بنسبة بلغت 98.55%. وأثنى خليل على قبول الرئيس عمر البشير بالنتيجة، قائلاً إنه قبلها بروح طيبة عالية وقدر عمل المفوضية ونحن نشكره على ذلك.