اعلنت لجنة بالمجلس الوطني انها بصدد فتح تحقيق حول حادثة قصف السيارة داخل مدينة بورتسودان واستدعاء وزيري الدفاع والدخلية وجهاز الامن، ووجه عدد من النواب انتقادات لاذعة للاجهزة العسكرية الامنية بسبب تعاملها مع الهجوم الاسرائيلي وطالبوا بمحاسبة المقصرين. وحسب صحيفة (الصحافة ) تحفظ رئيس لجنة الامن والدفاع بالمجلس الوطني محمد مركزو عن التعليق على الحادثة بحجة ان اللجنة لا تريد التأثير على مجريات التحقيق، ولكنه اشار لاتصالات تمت مع الجهات المختلفة لجمع المعلومات ووصف الاعتداء بالعدواني، وقال انهم يؤيدون اي اجراء يمكن ان تتخذه الدولة في هذا الصدد، واكد ان اللجنة ستفتح تحقيقا حول القضية وتستدعي الجهات المختلفة لتوضيح ملابسات العملية ومن ثم رفع الامر للمجلس الوطني لاتخاذ القرار المناسب. وقال نائب رئيس لجنة الدفاع كمدان جودة ان اللجنة ستشرع في تجميع المعلومات حول الحادثة وستطلب من الجهات المختصة وزارات الدفاع والداخلية وجهاز الامن تمليكها الحقائق حول القصف تمهيدا لوضع تقرير مفصل، ووصف الاعتداء بغير المقبول. من جانبه، اعتبر النائب البرلماني المستقل عماد الدين بشرى الحادثة دليلا على افتقار البلاد لاجهزة الانذار المبكر التي تكشف الاختراقات، بجانب قوة العمل الاستخباراتي الاجنبي في السودان بدليل ضرب الهدف بدقة. واكد ان الامر يتطلب الحسم والمحاسبة للمقصرين وعدم المرور على الحادثة مرور الكرام، باعتبار ان الامر يدخل في صميم سيادة البلاد و حمايتها من اي عدوان خارجي. وافاد النائب اسماعيل حسين فضل عن المؤتمر الشعبي ان الحادثة تعتبر تطورا خطيرا لاسيما وانها تكررت، واكد انهم فور استئناف جلسات المجلس الوطني الاسبوع المقبل سيدفعون بطلب لاستدعاء وزيري الدفاع والداخلية «للتأكد من ان كان هناك هدف حقيقي لاسرائيل داخل السودان يجعلها تنتهك سيادة البلاد بهذة الصورة». وتساءل فضل عن جدوى الانفاق الكبير من الموازنة على بند الامن والدفاع بينما تعجز الاجهزة الامنية عن تنفيذ مهامها الاساسية في حفظ امن وحماية البلاد، وشدد على ان القضية تحتاج مساءلة حقيقية لتحديد مواطن الخلل، قائلا (لا يعقل ان يصرف على تلك الاجهزة كل ذلك الصرف وتأتي طائرة اسرائيلية وتضرب عمق مدينة بورسودان وتعود ادراجها سالمة). وفي ذات السياق قالت القيادية بحزب الأمة القومي لصحيفة ( الشرق الاوسط) الدكتورة مريم الصادق المهدي، إن ( الحادث إهانة للسودان ولشعبه، ويكشف عن الضعف الحكومي، وغياب الجهات المسؤولة عن أمن الوطن وفشلها في أداء دورها)، وطالبت المهدي بإقالة وزير الدفاع السوداني عبد الرحيم محمد حسين فورا ( بعد أن تكررت عمليات الاختراقات الأجنبية للأجواء السودانية) .