طبق جنوب السودان المعاملة بالمثل بحق الرعايا السودانيين بعد أن اتخذت الخرطوم خطوات عملية في هذا الاتجاه، وقالت وزارة الداخلية الجنوبية إن مواطني جمهورية السودان المقيمين في الجنوب يعتبرون أجانب اعتباراً من التاسع من أبريل الجاري. وأكد المفتش العام للشرطة بدولة جنوب السودان؛ أشويل بيتو، أنه سيتم تسجيل السودانيين ومنحهم إقامة مؤقته لتوفيق أوضاعهم حسب القوانين التي تحكم وجود الأجانب بدولة الجنوب. وقال بيتو في مؤتمر صحفي بجوبا، يوم الثلاثاء: "إذا أراد أي مواطن من جمهورية السودان الدخول لدولة جنوب السودان عبر الطرق البرية أو البرية أو الجوية لن يتأتى له ذلك إلا عبر تأشيرة دخول". وكان السودان قد منع جنوبيين من السفر عبر مطار الخرطوم بوثائقهم السودانية، كما اعتبرت الحكومة السودانية رعايا دولة الجنوب أجانب منذ 9 أبريل. الجنوب وأبيي " لجنة أمن مقاطعة الرنك بولاية أعالي النيل تمنع سفر الجنوبيين إلى السودان على خلفية انتهاء أجل بقاء الجنوبيين وتبرر الخطوة بالحفاظ على أرواح المواطنين الجنوبيين وممتلكاتهم "من جهته قال وزير الداخلية بدولة جنوب السودان؛ ألسون مناني مقاي، إن أبناء منطقة أبيي في جنوب السودان سيمنحون وثائق دولة الجنوب باعتبار أن أبيي منطقة تتبع للجنوب. إلى ذلك قررت لجنة أمن مقاطعة الرنك بولاية أعالي النيل الجنوبية، منع سفر الجنوبيين إلى السودان، على خلفية انتهاء أجل بقاء الجنوبيين في السودان. وقال محافظ مقاطعة الرنك؛ دينق أكوي كاك، في حديث عبر إذاعة محلية، إن السلطات بولاية النيل الأبيض السودانية منعت مواطني دولة الجنوب من دخول السودان بعد أن سمحت لهم بذلك في وقت سابق. وأرجع أكوي، الذي لوح بالتعامل بالمثل، القرار إلى أنه يأتي حفاظاً على أرواح المواطنين الجنوبيين وممتلكاتهم.