بلغ حجم التبادل التجاري بين السودان ومصر 731 مليون دولار ويستورد السودان من مصر الآلات والمعدات والمنتجات الكيماوية ووسائل النقل والمنسوجات، في حين يصدِّر الحيوانات الحية واللحوم والفول السوداني والجلود، وتحتل مصر المرتبة الثالثة بعد الصين والإمارات في التصدير للسودان. وأكد رئيس المجلس الأعلى للاستثمار بالسودان، مصطفى عثمان إسماعيل، سعي الجانبان لرفع حجم التبادل التجاري إلى أضعاف الرقم الحالي الذي لا يعكس حجم العلاقات بين البلدين. وأشار إسماعيل إلى أن حجم الاستثمارات المصرية حالياً في السودان بعد موافقة البلدين على إنشاء 213 مشروعاً تبلغ أكثر من 7,7 مليارات دولار باستثمارات مصرية بالسودان منها 117 مشروعاً في الصناعة باستثمارات 1,2 مليار دولار و79 مشروعاً خدمياً باستثمارات أكثر من 6,4 مليارات دولار و17 مشروعاً في الزراعة باستثمارات 89 مليون دولار. وأوضح د. مصطفى عثمان أن المشاريع التي تم تنفيذها حتى العام 2011 بلغت 49 مشروعاً باستثمارات 683 مليون دولار، منها 31 مشروعاً في الصناعة باستثمارات 505 ملايين دولار، و16 مشروعاً خدمياً باستثمارات 174 مليون دولار، وفي الزراعة باستثمارات أربعة ملايين دولار. وأكد الاتفاق على إقامة منطقتين صناعيتين مصريتين بالسودان الأولى في أمدرمان لصناعة الجلود على مساحة مليوني متر مربع وأخرى في ولاية النيل الأبيض، بجانب إقامة مصنع سكر ضخم لتغطية الاستهلاك السوداني.
