قررت دائرة طعون الانتخابات بالمحكمة العليا السودانية برئاسة القاضي محجوب الأمين وعضوية سرالختم صالح وبنجامين ياك بشطب الطعن المقدم من حزب المؤتمر الشعبي في كافة نتائج الانتخابات ، كما قررت إلغاء نتيجة الانتخابات وإعادة الاقتراع في الدائرة 12 ولائية بورتسودان الثالثة . وقال قاضي المحكمة العليا رئيس دائرة الطعون القاضي محجوب الأمين إن قرار الشطب استند على أن تقديمه تم بعد انتهاء المدة ، باعتبار أن نتائج الانتخابات كانت تعلن تباعاً ويومياً ، وبالتالي يسرى ميعاد الطعن في كل نتيجة أعلنت في كافة المستويات من تاريخ إعلان النتيجة ، وليس من تاريخ إعلان آخر نتيجة في انتخابات ولايات جنوب السودان . وقال محجوب أن الطعن شُطِب لعدم اختصاص الدائرة بالنظر في الوقائع المتعلقة بادعاءات ممارسة الأساليب الفاسدة ، والتي ينبغي أن تثار وتثبت أمام مفوضية الانتخابات، وإذا قررت بطلان النتيجة يجوز الطعن في قرارها أمام دائرة المحكمة العليا ، مشيراً أن طعن حزب المؤتمر الشعبي شُطِب أيضا لأنّ المطالبة بالتعويض أمر يخرج من اختصاص الدائرة، والتي تختص فقط بالنظر في طعون نتائج الانتخابات. وكانت المحكمة قد قبلت الطعن المقدم من المرشح المستقل محمد علي الزبير يوسف بالدائرة (12) ولائية بورتسودان والذي طعن في عدم ظهور اسمه ورمزه في بعض أيام الاقتراع وفي بعض المراكز الأمر الذي أثَّر على النتيجة وأصدرت الدائرة قراراها بإلغاء النتيجة وإعادة الانتخابات.