نفت وزارة الصحة بولاية الخرطوم أن تكون لها أي علاقة بمحتوى وخلاصة تقرير لجنة تقصي الحقائق حول أسباب وفيات مستشفى بحري الثلاث، وقالت في بيان إن عضوين من اللجنة لم يبديا وجهتي نظرهما لوزير الصحة حول الفقرة التي ذكراها في بيانهما. لكن د. ياسر ميرغني قال ل (الأهرام اليوم) إن معركتهما ليست مع الوزارة وإنما مع رئيس ومقرر اللجنة بخصوص البيان المعدل، وتساءل: لماذا قبلت وزارة الصحة بولاية الخرطوم البيان رغم أن الموقعين عليه لم يتعد عددهم اثنين، هما رئيس اللجنة ومقررها، من بين (6) أعضاء، وتحدى د. ياسر وزارة الصحة بتسليم محضر التحقيقات للصحف كاملاً وحذرها من إصدار بيانات مختصرة.