شكت وزارة الصحة بولاية النيل الأزرق من مهددات تحيط بالولاية ،تتمثل في تسلل النازحين إلى داخل الولاية مع الحدود الاثيوبية نسبة لعدم وجود ضوابط على الحدود، وطالبت الوزارة بضبطها للحد من انتشار الأمراض. وشكت وزيرة الصحة بولاية النيل الأزرق، هويدا يس ،في تصريحات صحافية، من اشكالية تواجه الولاية في نقص الاختصاصيين ،وطالبت بزيادة السقف الدوائي باعتبار ان المستشفيات لا تتحمل نقص الأدوية لمدة ساعة واحدة. ولفتت الوزيرة الى ان الولاية فقدت كمية من عربات البرامج التابعة لوزارة الصحة خلال الحرب التي شهدتها ، وكشفت عن تشكيل فرق طبية لتغطية مخيمات النازحين ومناطق التعدين الأهلي،وأعلنت الوزيرة عن انخفاض نسبة الاصابة بالملاريا عقب الأمطار التي شهدتها الولاية ،وعزت ذلك الى تفعيل غرفة الطوارئ في الخريف على مستوى المحليات.