اعتبرت الحكومة أن تأجيل عقد اجتماعات اللجنة السياسية الأمنية المشتركة بين دولتي السودان وجنوب السودان، سيكون له تأثير سالب على إنفاذ اتفاق التعاون الشامل المبرم بين البلدين، وما أعقبه من اتفاقيات تفصيلية. وقال عضو اللجنة السياسية الأمنية المشتركة عن الجانب السوداني، المعز فاروق، في تصريح لقناة "الشروق": إن أي تأجيل لاجتماعات اللجنة، أو تأخير في إنفاذ بند الترتيبات الأمنية الذي نصّت عليه مصفوفة التعاون المشترك الموقعة بين البلدين، يكون ذا أثر سالب على سير تنفيذ بقية اتفاقيات التعاون المشترك. وأشار إلى أن الترتيبات الأمنية تعتبر الأساس لتنفيذ بنود مصفوفة التعاون المشترك، قاطعاً بأهمية الأمن والسلام بين الدولتين حتى لا تتأثر الاتفاقات الموقعة بينهما.