استنكر الأزهر الشريف الفيلم المسيء للرسول (عليه الصلاة والسلام) واعتبره ذريعة لفتنة طائفية، بينما اعتبره حزب "الحرية والعدالة"، الذراع السياسية للإخوان، أنه "محاولة فاشلة لإثارة هذه الفتنة". ودانت مؤسسة الأزهر دعوات الإساءة للنبي الكريم. من جانبه أكد مفتي مصر الدكتور علي جمعة، رفضه وشجبه لما قام به بعض المتطرفين من أقباط المهجر من إعداد فيلم مسيء للرسول، موضحاً أن هذه الإساءة تمسّ مشاعر ملايين المسلمين في العالم. ورفض مفتي الجمهورية التعلل بحرية الرأي والتعبير لتبرير وتغطية هذه الإساءة، مؤكداً أن الاعتداء على المقدسات الدينية لا يندرج تحت هذه الحرية، بل هو وجه من وجوه الاعتداء على حقوق الإنسان بالاعتداء على مقدّساته. ودعا المفتي أنصار حقوق الإنسان والهيئات الأخلاقية والدينية وأهل الحكمة من العقلاء والمفكّرين إلى التصدي لانتهاك المقدسات لأي دين من الأديان، حتى يسود العالم المحبة والإخاء. وفى السياق ذاته، دانت وزارة الأوقاف المصرية في بيان لها موقف ما سمّتهم "غلاة أقباط المهجر" على عرض الفيلم المسيء للرسول الكريم، والدعوة لما يسمى اليوم العالمي لمحاكمة الرسول.