نفى الحزب الشيوعي أي علاقة له بلجان المقاومة السودانية . و قال الحزب في بيان اطلع عليه "باج نيوز" إن من اسمتهم اللجان الناطقين باشمها ليسوا أعضاء في الحزب و أضاف "علماً بأن الحزب لا يتدخل في نشاط لجان المقاومة، ويحترم استقلالها وعملها النابع منها". و أوضح "يود حزبنا أن يوضح أن ما يُسمى بلجان المقاومة السودانية التي تستبطن شكلاً مركزياً يتعارض مع تنسيقيات لجان المقاومة في الولايات والمدن والاحياء التي شكلها افقي".