أمن شريكا إتفاقية نيفاشا المؤتمر الوطني والحركة الشعبية على أن تكون مفاوضات الشريكين لقضايا ما بعد الإستفتاء سودانية دون تدخلات خارجية. وأتفق الشريكان على وضع تصور واضح للمبادئ الأساسية للتفاوض وتكوين سكرتارية مشتركة وتحديد مهامها لتسهيل أعمال المفاوضات بمساعدة مفوضية متابعة اتفاقية السلام. وأكد وزير رئاسة مجلس الوزراء السوداني د. لوكا بيونق دينق على أن الروح التي سادت بين الطرفين تؤكد التزامهما بمواصلة انفاذ اتفاقية السلام وقضايا ما بعد الإستفتاء باعتبارهما القضايا التي تؤمن العلاقة القوية السائدة بين شمال وجنوب السودان.