مكتبة السودان تتبع لمكتبة جامعة الخرطوم تلك المكتبة التي تأسست مع تأسيس كلية غردون التذكارية في عام(1902م) إثر النداء الذي أطلق عقب سقوط الخرطوم ووقوعها تحت سيطرة الحكم الثنائي(1898- 1956م). وذلك من أجل تخليد ذكرى الجنرال شارلس غردون الذي قتل بالخرطوم إبان فتحها بواسطة قوات المهدية(1884- 1898م). حيث تشكلت هيئة ببريطانيا لجمع التبرعات من أجل تخليد ذكراه .. والتي قررت بناء مدرسة ابتدائية على ضفة النيل الأزرق الجنوبية لقبول التلاميذ من كل أنحاء البلاد القادمين من المدارس الأولية القليلة حيث لم يتجاوز عدد المقبولين أربعين طالباً. ثم أضيف إليها قسم ثانوي (المدارس العليا) وكان الهدف الأساسي من قيامها مد الإدارة الحكومية بأعداد من الموظفين (كتبه ومحاسبين ومترجمين ومعلمين..) إذا كانت الوظائف الإدارية الوسطى وقفاً على المصريين والشوام وكانت الوظائف الدنيا من نصيب الوطنيين. ثم صارت(المدارس العليا) كلية الخرطوم الجامعية وأضيفت لها مدرسة كتشنر الطبية ومدرسة القانون وأخرى للعلوم البيطرية.وتم ربطها بجامعة لندن للحصول على شهادة جامعة لندن في بعض العلوم مثل (الآداب). وعند إعلان استقلال البلاد في عام 1956م وصدور قانون جامعة الخرطوم أصبحت جامعة الخرطوم كأول جامعة وطنية بالبلاد ومن ثم توسعت وتنوعت الكليات والأقسام. وطوال تلك السنوات كانت المكتبة تمثل إحدى المؤسسات المهمة للعملية التربوية وصاحبت تطور تلك الفصول والأقسام والكليات كما وكيفا.. ومن غرفة واحدة كانت تحتلها في مبنى الكلية الذي بني في شكل المربع الذي ينقصه الضلع الرابع . تطورت لتحتل كل المبنى بطابقيه الأرضي والأول ماعدا الجناح الشرقي الذي يشغله قسم الفيزياء. وفي عام 1945م أهدى السير دوقلاس نبوبولد السكرتير الإداري لحكومة السودان (1939- 1945م) مجموعته الخاصة ومجموعة مكتب السكرتير الإداري إلى مكتبة الكلية وبلغ عدد مجلداتها حوالي خمسة عشر ألف مجلد وقد أطلق على مكتبة الكلية (مكتبة نيوبولد). وحوت تلك المجموعة الكثير من كتب السودان.. ولكن نواة تلك الكتب والتقارير تشكلت وتكونت بالقاهرة وبالتحديد في تلك الوحدة التي أنشأها الرائد ريجالند ونجت والذي أصبح فيما بعد حاكماً عاماً للسودان (1900- 1916م) وذلك عندما كان ضابطاً في الجيش المصري (1883م) وأختير ليؤسس قلم المخابرات والذي أوكل إليه جمع المعلومات والأخبار عن أوضاع السودان توطئة لغزوه فيما يعرف في التاريخ ب (حملة النيل) وذلك في عام 1898م بقيادة الجنرال كتشنر. واستطاع ونجت خلال تلك الأعوام التي سبقت الغزو وتحرك الجيوش أن يجمع الكثير من التقارير والخرائط والكتابات وليساعد على تهريب بعض الأجانب من الذين كانوا أسرى بأم درمان.أمثال الضابط النمساوي سلاطين باشا والذي وضع كتاباً فيما بعد اسماه «السيف والنار في السودان» كما خطط وأشرف على هروب القس أورهارد والذي أصدر أيضاً كتاباً بعنوان عشر سنوات من الأسر في معسكر المهدي وقام ونجت بترجمته من الألمانية إلى الإنجليزية. وبعد غزو السودان 1898م ودخول الجيش الغازي بقيادة الجنرال كتشنر جاء الضابط ونجت مساعداً وسكرتيراً خاصاً للقائد- وجاء حاملاً معه معظم محفوظات مكتب المخابرات بالقاهرة من كتب ومخطوطات وخرائط وتقارير ووثائق. عقب معركة كرري وسقوط مدينة أم درمان وهزيمة جيوش المهدية وانسحاب الخليفة عبد الله وقادة المهدية نحو الغرب ومقتله فيما بعد في موقعة أم دبيكرات. قام ونجت بتكليف مجموعة من الموظفين المصاحبين للحملة وفي مقدمتهم نعوم شقير (المؤرخ فيما بعد) بجمع الوثائق والسجلات والدفاتر من المؤسسات الرسمية للمهدية (بيت المال- مطبعة الحجر) ومن منازل الخليفة عبد الله وقادة الأنصار.
