أعلنت مصادر في وزارة التعليم العالي السعودية عدم الاعتراف بشهادات الدراسات العليا الصادرة من الجامعات السودانية باستثناء جامعة الخرطوم.وجاء التوضيح في أعقاب فضيحة شهادة دكتوراة مزورة وغير نظامية حصل عليها مدير تعليم محافظة بالمدينة المنورة، صادرة من جامعة النيلين.وفيما بدأت وزارة التربية والتعليم السعودية التي كشفت الأمر، اجراءات ازاحة حرف « الدال » عن مدير التعليم، أكدت المصادر أن الدكتور المزور، ارتكب مخالفتين الأولى أن شهادة الدكتوراة ممنوحة من جامعة النيلين في العاصمة السودانية (الخرطوم)، وهي جامعة غير معترف بها في المملكة، والثانية أنه لم يكن مبتعثا أو منتظما في برنامج الدراسة. واستبعدت مصادر في وزارة التعليم العالي السعودية اعتماد أي شهادات دكتوراة صادرة من أية جامعة في السودان، باستثناء جامعة الخرطوم، ولا يعتمد للمعادلة من جامعة النيلين إلا شهادات درجة البكالوريوس فقط، بينما الدكتوراة ترفض معادلتها فورا، لأنها ليست من الجامعات الموصى بها لنيل درجات أعلى من البكالوريوس .