اتهمت الأحزاب الجنوبية الحركة الشعبية بضلوعها في عمليات تصفيات قبلية ومجازر بشرية طالت قبيلتي النوير والشلك بجانب التنسيق العسكري بينها وجيش الرب لضرب الاستقرار وإبادة القبيلتين بولايتي الوحدة وأعالي النيل. وكشف الأمين العام لحزب جبهة الإنقاذ الديمقراطية المتحدة ديفيد ديل جال عن عمليات تجنيد قسري تنفذها الحركة الشعبية للأطفال دون سن «13» عاماً والزجّ بهم في معارك دامية ضد المنشقين عن الجيش الشعبي.