تصاعدت حدة الخلافات بين طلاب كلية الطب بجامعة القضارف وإدارة الكلية ،في اعقاب فصل طالبين من الكلية أكاديميا . ونظم طلاب الطب بالجامعة حشدا وقرروا الدخول في الاعتصام ومقاطعة زيارة رئيس الجمهورية،ومقاطعة تخريج الدفعات من العام 2003م وحتي العام 2010م . وطالب المحتشدون بتعديل لوائح الجامعة واستيعاب التخصصات المتميزة لاكمال النقص ،مشيرين الى تدهور الأداء الأكاديمي ،وطالب الطلاب إدارة الجامعة بالتحري والبحث وتغيير نظم الجامعة التي أصبحت تستقبل الراسبين والمفصولين وتكوين لجنة لاعادة صياغة اللوائح.