شكت وزارة الصحة الاتحادية من هجرة الكوادر المدربة،وغياب سياسات جذبهم وابقائهم ،بجانب الشكوى من تكرار الوبائيات مثل «السحائي - الاسهالات - الحمى الصفراء» وضعف مقدراتها للاستجابة، مشيرة الى وجود تضارب في السياسات والنظم الصحية وضعف الموارد المالية المخصصة اللازمة للتعهدات الوطنية والدولية. وكشفت الخطة الاستراتيجية القومية للصحة 2012 - 2016 ،عدم تضمين الأمراض غير السارية في حزمة الخدمات الصحية الأساسية رغم الزيادة المضطردة في انتشارها ،مشيرة الى ضعف جودة الخدمات المقدمة وعدم تبني معايير الأداء والبروتوكلات العلاجية ،وأقرت الخطة بوجود توزيع غير عادل للقوى العاملة الصحية . وأكدت عدم مطابقة المعايير الأساسية في المؤسسات الصحية بجانب غياب آلية تنسيق فعالة بين الأجسام الأساسية في القطاع الصيدلاني فضلاً عن ضعف غياب وأنظمة ضمان جودة الأدوية خاصة على مستوى الولايات، وأقرت بتدني توفر حزمة الخدمات الصحية الأساسية.