قالت القوات المسلحة، إنّ ما يقوم به (جيش الرب) وقائده جوزيف كوني لا يمت للسلام بشئ، وأن الأخير غير موجود بالأراضي السودانية، ونفى صحة ما نقلته بعض وكالات الأنباء عن وجود المتمرد اليوغندي بالأراضي السودانية من قبل أو حالياً. وأكد العقيد الصوارمي خالد سعد الناطق باسم القوات المسلحة حسب (شبكة الشروق)، أن ما تناوله التقرير عار عن الصحة، وأن أجندة جوزيف كوني لا تخدم السلام وإستراتيجيته في السودان أو خارجه. وقال إنّ القوات المسلحة السودانية لا مصلحة لها إطلاقاً في حماية أو استضافة قائد جيش الرب أو أي متهم بالإرهاب وخارج على دولته. واتهم الصوارمي بعض المنظمات المعادية للسودان بتلفيق مثل هذه الشائعات وبثها في الفضاء الإعلامي، وأضاف: العديد من المنظمات تجوب السودان، وإذا كانت مثل هذه الادعاءات تدعمها الأدلة والشواهد لما خفيت على أحد. وكان تقرير صادرٌ عن مجموعة (المبادرة لحل أزمة جيش الرب) التي تتخذ من واشنطن مقراً لها، اتهم عناصر من الجيش السوداني بتقديم ملاذ مؤقت لكوني وقادة آخرين في جيش الرب بشكل فاعل في الأراضي التي يسيطر عليها السودان من العام 2009م إلى يناير 2013م على الأقل.