على خلفية الخلافات التي نشبت وسط قيادات الحركة الشعبية قطاع الشمال بين مالك عقار ونائبه بندر ، تطور الخلاف بشكل خطير بعد عودة الكرمك الى يد الجيش السوداني ، وقال أن عقار عندما قابله في جوبا بعد شهرين من سقوط الكرمك ، قال له " لو كنت بالجبهة لكنت أعدمتك أنت واحمد العمد وآخرين " وأكد بندر ان خلافه مع مالك عقار يرجع إلى خلافات حول أجندة الحركة ، مشيرا إلى أن معه بعض القيادات ظلوا يرفضون فوضى الحرب وبعد المخططات التخريبية يطالبون بالتنمية بينما يسعى مالك عقار الى تنفيذ سياسات وأجندة خارجية ، قال أنها تخطط لاشعال الحرب في المنطقة ، وقال انه الان يدير شؤونه الحاصة وان لا صلة له بالجبهة الثورية ، كاشفا عن انه يملك عربتين " هايس " يعملان في نقل البضائع من جوبا الى يوغندا . اقر علي بندر سيسي نائب مالك عقار رئيس الحركة الشعبية بوجود خلافات واسعة وسط القيادات الميدانية بالحركة الشعبية قطاع الشمال. وهاهى الخلافات تطفو إلى السطح من جديد وقال بندر فى تصريحات له أنه تطور الخلافات مع مالك عقار وصل إلي طريق مسدود، مما دفعه إلي اعتزال العمل العسكري منذ سقوط الكرمك، وقال إنه متواجد بجوبا ببطاقة لاجئ صادرة من الأممالمتحدة. وأضاف أنه تفرغ للتجارة بين جوبا وكمبالا للاتفاق علي أسرته، وذهب بندر لأبعد من ذلك عندما قال إن عقار قد وشي به لدي مخابرات الجيش الشعبي ومخابرات دولة الجنوب، من أجل وضعه قيد الإقامة الجبرية، غير أنه كشف عن حصانته ببطاقة الأممالمتحدة التي قال أنها ستحول بينه وبين مخططات مالك عقار الذي قال بندر إنه ظل يخطط لاغتيال شخصيته بفبركة المعلومات الكاذبة عنه، وأكد بندر أنه لا ينكر أنه من أوائل القيادات التي نالت عضوية الحركة الإسلامية، وإلا أنه قال إن خلافات مع بعض القيادات قد دفعته إلي الانضمام للحركة الشعبية، قاطعاً بأن لا علاقة له بالجبهة الثورية. فرضت دولة الجنوب الإقامة الجبرية على القيادي بالجبهة الثورية على بندر لحين فض الاشتباكات بينه وبين مالك عقار. وأبلغت مصادر مطلعة بالجبهة الثورية أن الخلافات بين على بندر وعقار تعود إلى إبلاغ الأخير لرئيس حكومة الجنوب أهمية تحجيم حركة بندر خلال المرحلة القادمة خاصة بعد قيامه بتأليب العديد من أبناء قبيلة (الأدوك) داخل صفوف الجيش الشعبي وتحريضهم على الانشقاق من منظومة الجيش الشعبي . وأكدت المصادر أن خلافات عقار طالت العديد من القيادات العليا لقبيلة على بندر بعد أن قام بتعيين إبن أخته قائداً لهم مؤكدة أن إبعاد بندر من مناطق القتال كانت تمثل أحد مسببات عقار التي أقنع بها رئيس حكومة الجنوب بالإبقاء على بندر قيد الإقامة الجبرية بجوبا خاصة وان أغلب أبناء قبيلته يمثلون العناصر القوية داخل منظومة الجيش الشعبي. والبرجوع إلى الوراء قليلا و في عام 2006م تحديدا كان علي بندر أسيس، يجمع حوله أكثر من (1500) من أبناء قبائل المابان، الأنواك، الرقاريق، برون الشيمي، برون الزريبة، برون جوط، برون ميك ، وكان جلهم قد خبر العمل العسكري، إذ كانوا من مرافيت الجيش السودانى والشرطة، وبعضهم كان ضمن قوات الدفاع الشعبي الذين قاتلوا مع الجيش السودانى، جنباً إلى جنب دفاعاً عن أرضهم وعرضهم قبل توقيع اتفاقية السلام. وخلال فترة وجيزة شهدت منطقة الرديف تدافعاً غير مسبوق لأبناء مناطق: (بوط، رورو، بك، أحمر سيدك، أقدي، شيرا، بلنق، ديرنق) أملاً في تعيينهم ضباطاً بالجيش الشعبي حسب وعود غمرهم بها بندر. وكان علي بندر يرفع تمام إنهاء المهمة بنجاح للقائد سايمون بن قائد القوات المشتركة جانب الجيش الشعبي وقت ذاك، ليقوم سايمون بدوره برفع الأمر لمالك عقار بغية رفعه هو الآخر لسلفا كير، ومن ثم يتم اعتمادهم قوات تابعة للجيش الشعبي بولاية النيل الأزرق. نجاح علي بندر في مهمة تجميع قوات خارج نطاق اتفاق الترتيبات الأمنية، قوبل بامتعاض من قبل مالك عقار لجهة فشله في هذه المهمة من قبل، وبإيعاز من سلفا يتم تعيين علي بندر قائداً للقيادة العسكرية للجيش الشعبي قطاع النيل الأزرق، لتتقد شرارة العداء الخفي بين بندر وعقار، ثم إن أكثر ما كان يؤلم عقار هو تمدد قبائل البرون على حساب قبائل الأنقسنا وسيطرتهم على مفاصل الجيش الشعبي المؤثرة. علي بندر أسيس للذين لا يعرفونه، هو أحد أبناء قبيلة البرون بولاية النيل الأزرق، وكان من ضمن قادة قوات دفاع الجنوب بقيادة الفريق فاولينو ماتيب، ونفذ إلى صفوف الجيش الشعبي عبر الترتيبات الأمنية التي قضت بضم قوات فاولينو للجيش الشعبي باعتبار ذلك أحد مخرجات مؤتمر الحوار الجنوبي الجنوبي الذي عُقد بمدينة جوبا عقب توقيع اتفاقية السلام، كما أن نشاط علي بندر الطاغي على مالك عقار وكان نشاطه الملحوظ أهله لنيل ثقة القيادة بجوبا حتى صار نائباً للوالي، وكان يطير إلى هناك دون علم عقار لتلقي تعليمات إدارة الجند، ويعود وهو يحمل صكوكاً ترفع من أسهمه وقدره لدى الجند. ثم يكتشف عقار هذه التحركات المريبة، ويعمل للتخلص من بندر، حيث يسلك طريق ما يعرف بثورة المهمشين ضد المركز، ويضع الخطط والتكتيكات العسكرية الهزيلة، دون التنسيق مع نائبه التنفيذي وقائد قواته العسكرية، حتى إذا حاول بندر الانسحاب وسط وابل من الرصاص، كانت رصاصة واحدة كفيلة بإزاحته عن طريقه للأبد. هكذا كان يخطط عقار، لكن بندر ينجو من الموت ولم ينجُ من رصاصة تستقر عند قدمه، ليعلن عقار سعادته بنجاة قائد الجند وهو في الحقيقة كان يتجرع مرارة فشله وسوء تقديره.
