قال وزير النفط بدولة جنوب السودان ضيو ستيفن إن وجود سودابت بجوبا وانتهاجها لطرق الإدارة السابقة أمر ليس بالقانوني، ووصف وضعية تشغيل الشركة بغير السليم، موضحاً أن القرار جرى اتخاذه بناءاً لمعطيات الواقع الذي تشكل بعد الانفصال. ووصف وزير النفط بدولة الجنوب خلال المؤتمر الصحفي الذي عقده بجوبا القرار الذي صدر من رئاسة دولة الجنوب القاضي بأيلولة أسهم شركة سودابت التابعة لحكومة السودان إلى أصول شركة نايل بت المملوكة للجنوب بأنه قرار يؤكد سيادة الجنوب على حد قوله. وأعلن أن دولة الجنوب وضعت سياسات جديدة، فيما يتعلق بملف النفط والتعامل مع الشركات الأجنبية وفق استراتيجية معينة، خاصة مع الشركات التي تملك عقودات سابقة مع حكومة السودان. الجنوب يرغب في التسوية وأبدى وزير النفط رغبة حكومة جنوب السودان في التوصل إلى اتفاق عاجل حول ملف البترول وفقاً للمعايير الدولية. " وزير النفط يبدي رغبة حكومة جنوب السودان في التوصل إلى اتفاق عاجل حول ملف البترول وفقاً للمعايير الدولية " وكانت دولة جنوب السودان أصدرت قراراً يتم بموجبه مصادرة أسهم شركة سودابت المملوكة لحكومة السودان، وقامت بتحويلها إلى صالح شركة نايل بت المملوكة لحكومة جنوب السودان. ومن جانبها أبدت الخارجية السودانية استغرابها لهذه الخطوة من حيث مضمونها وتوقيتها، واعتبرتها خطوة غير موفقة تتناقض مع روح التعاون التي ظلت حكومة السودان تبديها طيلة الفترة التي أعقبت انفصال الجنوب ومن ذلك السماح بتصدير نفط الجنوب على الرغم من عدم التوصل لاتفاق حتى الآن بشأن استخدام البنيات الأساسية لصناعة النفط التي تمتلكها حكومة السودان.