نددت الحركة الشعبية بممارسات حكومة المؤتمر الوطنى فى ملاحقة المسيحيين . وقال الاستاذ ارنو نقتلو لودي الناطق الرسمي بإسم الحركة فى بيان، ان نظام المؤتمر الوطني اعتقل حتي الآن (9) من القيادات المسيحية من بينهم قساوسة ومبشرين. وقامت الأجهزة الأمنية في المقابل بهدم كنيسة ومركز صحي يتبع لها و مداهمة مركز الثقافة الانجيلية في الخرطوم ومصادرة عدد من الكتب والافلام والارشيف . واكد ان استهداف المسيحيين جاء بعد التوجيهات الرافضة للتعدد الديني والتنوع الثقافي التي اصدرها الرئيس عمر البشير بالقضارف قبل عامين. وحذرت قيادة الحركة الشعبية نظام المؤتمر الوطني من مغبّة إستهداف المسيحين في السودان.