حذَّر قيادي في حزب المؤتمر الوطني من خطورة إعلان إسرائيل ودولة جنوب السودان عن قيام علاقات دبلوماسية بينهما ، وقال ان ذلك يشكِّل خطرًا على العرب والمنطقة برمتها. وقال القيادي بالحزب الوطني الحاكم في السودان د.ربيع عبد العاطي في تصريحات لوكالة قدس برس (نحن لا نخشى هذه العلاقات على السودان وحده ، وإنما نخشاها لتبعاتها على العرب والمسلمين في كل مكان ، وفي إفريقيا بوجه خاص ، فهذا خطر عظيم يتهدَّد المنطقة برمتها). واعتبر د.عبد العاطي الإعلان عن العلاقات الرسمية بين إسرائيل ودولة جنوب السودان إشارة واضحة للجميع ، وعليهم أن ينتبهوا أن هذا الذي يجري يتهدَّدهم جميعًا ، وأضاف "لقد نبَّهنا لذلك منذ البداية وكافحناه بمفردنا، لكن العون الذي قُدِّم إلينا لم يكن بمستوى التحدي". وعاب عبد العاطي على العرب والمسلمين "تهميشهم" لما سمّاه "الخطر الإسرائيلي" في جنوب السودان، وقال: "واضح جدًا أننا تُركنا وحدنا نغالب هذه الإستراتيجية لفترة طويلة جدًا ، والعالم العربي والإسلامي لم يقدِّم ما يمكن أن يوقف هذه المخطَّطات ، نحن نشعر بأن هناك تقصيرًا عربيًا وإسلاميًا في الماضي ، وقال أن الرسالة واضحة، ونأمل أن تكون إجراءات حكومة جنوب السودان موقظة للعالم العربي والإسلامي ، إلا أن الأمر قد أصبح أكثر خطورة من أي وقت مضى. وأشار د.عبد العاطي إلى أن جنوب السودان بعد الإعلان رسميًا عن العلاقات الدبلوماسية بينه وبين إسرائيل ، تحول إلى صورة مصغرة للسياسات الأمريكية والإسرائيلية والغربية في إفريقيا.