انتقد الحزب الشيوعي القوى السياسية الداعية لخيار الانفصال وتبني أجندات تخدم مصالح خارجية تسعى لعرقلة المواقف الوطنية. وقال القيادي بالحزب الشيوعي صديق يوسف للمركز السوداني للخدمات الصحافية ان القوى السياسية التي تحاول تمرير أجندتها الخاصة ضد المصالح القومية المشتركة ستترك الباب مفتوحاً لدخول تيارات خارجية معادية تسعى لتدمير السودان. وأبان ان هناك جهات محلية تحاول ان تجد لها موطئ قدم في الدولة الوليدة بغرض تقوية موقفها السياسي المتذبذب في الشمال، إضافة إلى هروبها من المشاركة في الموقف الوطني المشترك. وحذر يوسف من استخدام استفتاء جنوب السودان لأغراض شخصية وتشكيل أجسام معارضة وتبني خيارات انفصالية عدائية تعيد السودان لمربع الحرب، وقال ان هناك حراكا دوليا واسعا لزعزعة استقرار البلاد بتعقيد المسائل التفاوضية وإضعاف دور الزعامات والقبائل في مناطق التماس والحدود، والتقليل من دورها الوطني والتاريخي المشترك وإضعاف مستوى التعايش السلمي المعروف منذ القدم.