شكلت مستشارية الأمن القومي السودانية ووزارة مجلس الوزراء السوداني آلية مشتركة لإكمال تصور تأسيس بنية مؤسسات الدولة باستصحاب الرؤية الكلية لمفهوم الأمن القومي السوداني تضم ثمانية أعضاء مناصفة بين المستشارية وأمانة مجلس الوزراء. وقال مستشار الرئيس السوداني للأمن القومي الفريق مهندس صلاح عبد الله قوش في تصريح صحفي عقب الاجتماع المشترك بين الجانبين أن الاجتماع استعرض أهداف المستشارية وبرامجها وخططها الإستراتيجية للعام الحالي بجانب مجالات التنسيق بينها والأمانة العامة لمجلس الوزراء. وأكد قوش أن اتفاق السلام وإفرازات تنفيذه تعد أحدى الملفات الأساسية وخاصة فيما يتصل بحق تقرير المصير لجنوب السودان ، والتركيز على خيار الوحدة الجاذبة مع دراسة الخيارات الأخرى ومن بينها قيام دولتين متجاورتين ، مشيراً إلى ان المستشارية تمثل جهازا قومياً يستعين بالعديد من مؤسسات ومراكز البحث المختلفة.