في الوقت الذي تتهم فيه الحكومة السودانية بعض الجهات الخارجية بالوقوف وراء حكومة الجنوب وتقديم الدعم والسند لها في معركتها مع الخرطوم وبالأخص أمريكا وإسرائيل، وذلك غير مستبعد ومتوقع ومعروف ماذا تريد تلك الدول من السودان ،و تظهر دولة يوغندا على الخط وتعلن عن تقديم دعمها للجيش الشعبي، هنا يتبادر للذهن سؤال كبير ماذا تريد حكومة يوغندا من السودان ولم يعد هناك ما يربطها بالسودان وقد أصبح الجنوب فاصلاً بين كمبالا والخرطوم ولم تعد هناك حدود تربط بين البلدين، الأمر الذي دعا الحكومة السودانية للتقصي حول التصريحات اليوغندية لوزير الدفاع الأوغندي بالخصوص تقديم الدعم لجيش الحركة الشعبية ومقاتلة الجيش السوداني في أي وقت، وهذا ما كشفت عنه صحف الأمس التي تقول أن الحكومة السودانية قد شرعت في تحركات دبلوماسية مكثفة للتقصي حول تصريحات أطلقها قائد قوات الدفاع الأوغندية الجنرال اروندا نياكايريما أعلن فيها أن بلاده لن تتردد في مساندة دولة جنوب السودان حال اندلاع حرب بينه والسودان، ولم تستبعد تلك المصادر احتمال استدعاء وزارة الخارجية للسفيرة الأوغندية بالخرطوم لتوضيح الأمر، وقالت المصادر إن ما نقل عن المسؤول اليوغندي يعتبر تحريضاً مباشراً لزعزعة الأمن والاستقرار في المنطقة، في الوقت الذي تؤكد فيه الخرطوم أنها لا تدعم جيش الرب ولا سيما أن الحدود بين البلدين لم تعد موجودة، وشددت المصادر على أن الخرطوم لن تتردد في اتخاذ الإجراءات اللازمة تجاه تحريضات يوغندا، ووصفت المصادر هذا الحديث بالتدخل السافر والتمادي في خرق الاتفاقيات الإقليمية والدولية. وللوقوف على مدى تأثير تلك التصريحات يرى عدد من المراقبين أن تدخلات يوغندا في الشأن السوداني لم تنقطع يوماً، فقد ظلت طوال الحرب بين الشمال والجنوب تقدم الدعم لقيادة الجيش الشعبي حتى نال الجنوب الانفصال عن الشمال وكان من المفترض أن يتوقف الدعم عند هذا الحد ولكن استمراره هذا يعني أن يوغندا لا تريد أن تخسر الجنوب لاعتبارات عدة، منها الشأن الاقتصادي وبالأخص بعد تدخل حكومة كينيا وإعلانها عن فتح موانئها لتصدير النفط الجنوبي، وثانيها أن الجنوب يمكن أن يكون حليفاً إستراتيجياً لما يمثله من عمق بالنسبة ليوغندا في السياسة الإقليمية وباعتباره سوقاً للمنتجات والاقتصاد اليوغندي، كما أن يوغندا تعول كثيراً على دولة الجنوب في توفير فرص العمل والتشغيل لليوغنديين في مجالات الزراعة والنفط والإمكانات الكبيرة التي يتمتع بها الجنوب. فيما ذهب الخبراء إلى أبعد من ذلك بالقول عن تدخلات يوغندا في الشأن السوداني جاءت نتيجة للتخوف الأوغندي من تقديم حكومة السودان الدعم لجوزيف كوني قائد جيش الرب المعارض، وبالتالي تمكين جوزيف كوني من القوة التي تجعله يحكم السيطرة على شمال يوغندا يهدد بقاء ووجود الحكومة اليوغندية في المستقبل عاجلاً أم آجلاً وخاصة في ظل اتجاه جوزيف كوني وتبنيه لبرنامج قيام جمهورية النيل العظمى التي تقوم على أساس العرق والجغرافيا والنيل، وهذه الخصائص أصبحت موجودة وخاصة بعد انفصال دولة جنوب السودان، وهناك قراءات تؤكد أن التواجد القبلي لقبائل الأشوالي والمورلي وغيرها من القبائل النيلية المعروفة، تتواجد ما بين شمال يوغندا وجنوب السودان، وهذا التكامل العرقي والجغرافي يعزز من إمكانية قيام جمهورية النيل العظمى التي يحلم بها قائد جيش الرب، ومن هنا تأتي مساندة يوغندا للجيش الشعبي حتى لا يجد الجنوبيون أو الحركة الشعبية أنفسهم مظلومين من الدولتين، الأمر الذي يجعلهم يخلقون تحالفاً مع جيش الرب المطرود من حكومة يوغندا والحركة الشعبية المغضوب عليها من الخرطوم، ليجد الطرفان نفسيهما في خانة المظلوم الذي يبحث عن حقه، وتحالفهم يعني قيام جمهورية النيل، وبالتالي سيحدث ليوغندا ما حدث للسودان.