اتهم المؤتمر الوطني حكومة جنوب السودان بالتزوير في تسجيل أسماء الناخبين، بعدما أظهرت أرقاماً أن خمس ولايات جنوبية تجاوزت نسبة التسجيل فيها 100%. وقال المسئول السياسي بالمؤتمر الوطني إبراهيم غندور ، إن ثمة تزويراً واضحاً في معظم مراكز التسجيل بالجنوب ، مشيراً لازدواج في التسجيل ، بجانب تسجيل أفراد دون السن القانونية للانتخاب. ورفض الأمين العام للحركة باقان أموم اتهامات المؤتمر الوطني ، وقال إن عملية التسجيل نفذتها لجنة الانتخابات وليس حزبه. من جانبها أكدت مفوضية الانتخابات بالسودان أنها تحقق في بيانات تسجيل الناخبين ، وقال نائب رئيس اللجنة عبد الله أحمد عبد الله إن لجنته تحاول معرفة أسباب تلك الأرقام المرتفعة. جدير بالذكر أن خمس ولايات هي واراب والبحيرات وشمال بحر الغزال وغرب بحر الغزال في جنوب السودان بجانب ولاية جنوب كردفان في الشمال بين 107% إلى 140% من عدد الناخبين الذي جرى تقديره حسب الوثائق التي أعدتها لجنة الانتخابات.